Для диагностики иксодовых клещевых боррелиозов используют серологические и молекулярно-генетические методы. Необходимо отметить, что метод ПЦР в крови или ликворе человека уступает по чувствительности серологическим методам. Частота выявления ДНК боррелий методом ПЦР в иксодовом клеще достигает 80-95%, в то время как в крови и ликворе этот показатель составляет 20-38%. Поэтому целесообразно сохранить для последующего исследования иксодового клеща укусившего человека.